Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283 ms