Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms