Protein–RNA interactions for Protein: Q93052

LPP, Lipoma-preferred partner, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPPQ93052 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPPQ93052 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPPQ93052 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPPQ93052 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPPQ93052 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPPQ93052 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPPQ93052 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPPQ93052 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPPQ93052 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPPQ93052 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPPQ93052 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPPQ93052 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms