Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF397Q8NF99 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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