Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms