Protein–RNA interactions for Protein: Q15596

NCOA2, Nuclear receptor coactivator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA2Q15596 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA2Q15596 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA2Q15596 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA2Q15596 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA2Q15596 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA2Q15596 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA2Q15596 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA2Q15596 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA2Q15596 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCOA2Q15596 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA2Q15596 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA2Q15596 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA2Q15596 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms