Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TSTA3Q13630 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms