Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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