Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms