Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2C1P98194 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms