Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms