Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ERVS71-1P61550 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms