Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CASP9P55211 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASP9P55211 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CASP9P55211 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASP9P55211 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms