Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HADHBP55084 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HADHBP55084 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HADHBP55084 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HADHBP55084 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HADHBP55084 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HADHBP55084 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HADHBP55084 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms