Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACADSBP45954 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACADSBP45954 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACADSBP45954 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACADSBP45954 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACADSBP45954 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACADSBP45954 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACADSBP45954 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACADSBP45954 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACADSBP45954 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACADSBP45954 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms