Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ECHS1P30084 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ECHS1P30084 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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