Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJB2P29033 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJB2P29033 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJB2P29033 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms