Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI1P08151 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI1P08151 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms