Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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CLDN34H7C241 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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CLDN34H7C241 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CLDN34H7C241 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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