Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms