Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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USP35Q9P2H5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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USP35Q9P2H5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USP35Q9P2H5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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