Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms