Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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