Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF397Q8NF99 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms