Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DUSP18Q8NEJ0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms