Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATG16L2Q8NAA4 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.7 ms