Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMYD4Q8IYR2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms