Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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