Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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CTF1Q16619 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CTF1Q16619 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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