Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC3Q15034 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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