Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAMB3Q13751 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms