Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF5AQ12840 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF5AQ12840 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms