Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms