Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN1P49257 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms