Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PSMB10P40306 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms