Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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