Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC175P0C221 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC175P0C221 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms