Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN2BO60939 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms