Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
O00370 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
O00370 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
O00370 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
O00370 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
O00370 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
O00370 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
O00370 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
O00370 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
O00370 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms