Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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