Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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