Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms