Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms