Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNRF3Q9ULT6 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms