Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHPF2Q9P2E5 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms