Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
A4GALTQ9NPC4 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms