Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms