Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
POLDIP3Q9BY77 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms