Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms