Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPPQ6IPU0 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms